DISTRIBUIÇÃO DOS CASOS DE TUBERCULOSE PULMONAR MULTIRRESISTENTE PREVALENTES EM SALVADOR, BAHIA, BRASIL NO PERÍODO DE 2008 A 2011 E SUA RELAÇÃO COM OS PERFIS FILOGENÉTICOS DOS ISOLADOS
RITA TEREZINHA CARNEIRO¹, ERIVELTON DE OLIVEIRA SOUSA¹, EMILYN COSTA CONCEIÇÃO¹, MARCIO NATIVIDADE¹, ANDREA CABIBBE¹, TAANE CLARK¹, GRANT HILL-CAWTHORNE¹, RENATO BARBOSA REIS¹, MAURICIO LIMA BARRETO¹, RICARDO SOARES MAGALHÃES¹, DANIELA CIRILLO¹, ELIANA DIAS MATOS¹, THEOLIS COSTA BARBOSA BESSA ¹
1. FIOCRUZ BA - Fundação Oswaldo Cruz Bahia, 2. LACEN BA - Laboratório Central de Saúde Pública Professor Gonçalo Moniz, 3. UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro, 4. OSR - Ospedale San Raffaele Scientific Institute, 5. LSHTM - London School of Hygiene and Tropical Medicine, 6. SSPH - The University of Sydney School of Public Health, 7. UNIFACS - Universidade Salvador, 8. UFBA - Universidade Federal da Bahia, 9. UQ - University of Queensland, 10. SESAB - Secretaria de Saúde do Estado da Bahia, 11. REDE TB - Rede Brasileira de Pesquisa em Tuberculose
theolis@bahia.fiocruz.br

A genotipagem e a análise de distribuição espacial dos isolados de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) possibilitam discriminar sua origem e descrever sua dinâmica em determinada população, portanto, são importantes ferramentas na epidemiologia da tuberculose (TB). Adicionalmente, a predominância de um grupo filogenético pode estar relacionada a um maior fitness biológico. Neste trabalho, descrevemos o perfil genético da TB multirresistente (TBMR) em Salvador, Bahia entre 2008 a 2011, a partir de análise da coleção biológica mantida pelo laboratório de referência desta cidade. Nosso objetivo foi verificar a frequência e distribuição espacial dos grupos filogenéticos de Mtb e identificar clusters genéticos potencialmente associados a melhor adaptação a nossa população. Utilizamos como métodos principais de genotipagem o MIRU-VNTR (unidades repetitivas dispersas de número variável do genoma de Mycobacterium ) de 12 loci e o spoligotyping, realizados em 121 isolados, e adicionalmente o cg-MSLT (tipagem multilocus do genoma principal) e análise de SNPs (polimorfismos de base única), a partir do sequenciamento completo do genoma de 84 isolados. As famílias foram confirmadas por similaridade com os padrões registrados na base SITVIT. A árvore de similaridade foi obtida a partir dos SNPs com cutoff de 6 alelos. Para a análise espacial, os casos de TBMR prevalentes no período foram georreferenciados e analisados. Eles se concentraram nos bairros da Calçada, Comércio, Liberdade e Pau Miúdo, e apresentaram dependência espacial, em acordo com a distribuição da doença nos chamados “bolsões de pobreza”. Os resultados de genotipagem revelam predominância de algumas famílias/subfamílias, sendo mais prevalente a LAM 9 (25/121), onde encontramos por exemplo um cluster genético com 10 isolados originários de pacientes sem relação epidemiológica entre eles, e sem distribuição geográfica compatível com cluster espacial. Um estudo aprofundado dos clusters genéticos poderá evidenciar padrões de transmissão relevantes na adoção de medidas de controle da TB, e uma possível associação com fitness biológico.