VIGILÂNCIA MOLECULAR E ANÁLISES FILOGENÉTICAS DE DENGUE, ZIKA E CHIKUNGUNYA EM PACIENTES SINTOMÁTICOS DE SÃO JOSÉ DO RIO PRETO, SP, BRASIL |
Visando detectar padrões e mecanismos de circulação viral, diversas ações de vigilância estão sendo intensificadas, entre elas inquéritos sorológicos e vigilância molecular em diferentes regiões do país. Diante disso, o objetivo deste estudo é analisar a presença do Dengue virus (DENV), Chikungunya virus (CHIKV) e Zika virus (ZIKV), seus subtipos e genótipos associados em amostras clínicas de pacientes febris que procuraram os Serviços de Saúde do Município de São José do Rio Preto em um sistema de vigilância epidemiológica ativa. Para a pesquisa destes arbovírus foram utilizados oligonucleotídeos iniciadores específicos para o gene do envelope (ZIKV), NsP1 (CHIKV) e NS5 (DENV) através do RT-PCR em tempo real. Entre fevereiro de 2016 a junho de 2018 foram analisadas 1891 amostras de soro. Duzentas e nove amostras (11,1%) foram confirmadas como positivas para o ZIKV, 99 (5,24%) para DENV e três (0,16%) para CHIKV. Os sorotipos de DENV encontrados foram: 75% (74/99) DENV-2, 23% (23/99) DENV-1 e 2% (2/99) DENV-4. Importante ressaltar que foram observados sete casos de co-infecção por DENV-2/ZIKV e três casos de co-infecção por DENV-1/ZIKV. Por ser o sorotipo predominante as amostras de DENV-2 foram submetidas ao sequenciamento do gene do envelope e foram utilizadas para a reconstrução filogenética, mostrando a circulação do genótipo Americano/Asiático, porém com a presença de polimorfismo genético em relação às amostras detectadas no passado em nossa região. As amostras de DENV-1 foram genotipadas para SNP presente na posição 2021 do envelope e 8587 da proteína NS5, que diferenciam L1 de L6 dentro do genótipo V, mostrando a circulação predominante de L6 sobre L1. Nosso dados permitem concluir que embora Zika seja o arbovírus predominante em nossa região, dengue continua circulando, com ênfase no sorotipo 2. A circulação de DENV-1 e DENV-4 é residual dos últimos surtos (mesmo genótipos que circularam anteriormente, genótipo V e genótipo II, respectivamente). Além disto, CHIKV está circulando em baixa quantidade, o que possibilitaria a ocorrência de uma epidemia de larga escala no futuro. Este trabalho demonstra a importância de integração universidade-sistema de saúde através de estudos moleculares para o entendimento da origem e evolução dos arbovírus, enfatizando a importância da utilização dos mesmos como ferramenta de predição de epidemias em programas de vigilância epidemiológica. |