Docking molecular de uma nova classe de compostos tiossemicarbazonas e tiazolidinonas |
Um dos grandes desafios no tratamento da doença de Chagas está na descoberta de fármacos mais eficazes no combate do parasita Trypanosoma cruzi . As tiossermicarbazonas e tiazolidinonas são classes de compostos que vêm sendo investigadas para o tratamento da doença tendo como alvo uma importante enzima de T. cruzi , a cruzaína. As tiossemicarbazonas do presente estudo foram intermediárias na rota sintética das tiazolidinonas. Estima-se que o uso de métodos in silico pode reduzir os custos e o tempo de desenvolvimento de um novo fármaco em até 50%, pois o número de moléculas que precisam ser sintetizadas e testadas passa a ser drasticamente reduzido pelas suas altas capacidades de predição e confiabilidade destes métodos. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi realizar um estudo primário, analítico e experimental com o intuito de avaliar a afinidade predita de 9 tiossemicarbazonas (TD-01 a 09) e 9 tiazolidinonas (DR-01 a 09) pela enzima cruzaína. As estruturas dos compostos foram desenhadas no programa SPARTAN 08'. Os cálculos de docking foram feitos utilizando o programa GOLD 5.2 e a enzima cruzaína de T. cruzi como alvo (PDB: 3IUT). As análises das interações intermoleculares foram feitas no programa BINANA. Para os compostos TD, as soluções obtidas para o isômero E apresentaram valores de score ligeiramente mais elevados (melhores) do que o isômero Z destes compostos. O aminoácido ASN69 fez ligações de hidrogênio com a maioria dos isômeros E destes compostos (TD), o que aparentemente favoreceu esse isômero. Já para os compostos DR, o isômero Z obteve resultados melhores do que o isômero E, sendo favorecido pelo maior número de ligações de hidrogênio formadas com GLY66, MET68 e ASN69, pelos isômeros Z deste composto (DR). A diferença de score entre as soluções obtidas para as moléculas DR em relação aos compostos TD se deve, aparentemente, ao volume maior do chassi molecular dos compostos DR, pois os últimos possuem anel heterocíclico e adição de uma ligação dupla com um átomo de oxigênio e um grupo fenil aumentando o número de interações que estes compostos podem realizar. O melhor score da série TD foi 54,2 (TD-06, isômero E) e da DR foi 66,57 (DR-06, isômero Z). Ambos compartilham um fenil como substituinte, podendo isso ter influenciado no score . Com isso, estima-se que as tiazolidinonas (DR) possuem maior afinidade pela cruzaína do que as tiossemicarbazonas (TD), no entanto o composto TD-06 possui afinidade semelhante às tiazolidinonas. |