Comparação de métodos de extração de RNA para diagnostico de infecções por Zika Vírus
ANDRÉA CRISTINA BOTELHO SILVA 1, THAMYRIS FARJADO1, LUCAS RODRIGUES LARANJA 1, ALEXANDRA SIQUEIRA MELLO1, COORTE ZIKA GRUPO DE ESTUDO1, DANILA VEDOVELLO1, SAULO DUARTE PASSOS1
1. FMJ - FACULDADE DE MEDICINA DE JUNDIAÍ -Laboratório de Infectologia Pediátrica
andreabotelhobm@gmail.com

O Zika vírus (ZIKV), pertence a família Flaviviridae e gênero flavivírus e é transmitido por mosquitos do gênero Aedes, através da picada da fêmea infectada. Foi isolado em 1947 a partir de um macaco sentinela na floresta Zika em Uganda, leste da África e foi responsável por casos esporádicos em humanos na África e na Ásia, até recentemente, quando um grande surto ocorreu no Oceano Pacifico e nas Américas. A infecção pelo ZIKV é geralmente leve e autolimitada. Porém, houveram relatos de associação de infecção por ZIKV à casos de má formação congênita e microcefalia, devido à transmissão transplacentária e Sindrome de Guillan-Barré, em adultos. No Brasil, o ZIKV foi detectado maio de 2015 e mais de 700.000 casos já foram oficialmente notificados. O ZIKV é um vírus de RNA fita simples, positivo e apresenta envelope glicoproteico. O RNA é mais instável pois a presença do grupo 2'-hidroxila (-OH) o que o torna propenso a auto-hidrólise. Por essa razão, metodos moleculares que demandam a extração do RNA e seu posterior armazenamento, devem ser otimizados. Esse estudo realizou o diagnóstico molecular das infecções por ZIKV em gestantes acompanhadas em coorte. Foram avaliados dois métodos para extração por RNA, comparada a sensibilidade de detecção do vírus e quantificada a carga viral do ZIKV, por RT-qPCR. O RNA do vírus foi extraído a partir de amostras de urina e saliva, usando o protocolo Trizol como padrão, em comparação ao kit comercial Qiagen, 765 mães participaram do estudo, sendo que 53 foram positivas para ZIKA em alguma das amostras. Dessas, 53 foram destinadas à comparação dos métodos: A quantificação do RNA apresentou diferença entre os métodos, sendo que o Trizol extraiu em média 10,84 µg/uL de RNA e o Qiagen 13,0 µg/uL. Através da RT-qPCR, 07 amostras foram positivas pelo método Trizol e 15 pelo kit Qiagen. A Especificidade e sensibilidade do Qiagen em relação ao Trizol foram de 75% e 65%, respectivamente. Dentre os positivos, a carga viral teve variação de até 10% Contudo o Qiagen apresentou maior carga viral detectável. As metodologias aplicadas para extração em diagnostico foram adequadas, sendo que os valores de quantificação e a carga viral variaram muito de um kit para outro, com variação nos resultados positivos e negativos para os diferentes métodos.

 

Suporte Financieiro: FAPESP (SDP # 2016/08578-0 ); London School for Hygiene and Tropical Medicine; and Ministry of Health of Brazil Rede Zika Consortium (SDP # 861306/2017 e #861307/2017 ).

 

 



Palavras-chaves:  Detecção de ZIKV, Extração de RNA, Zika Vírus, Estudo de Coorte